C.C. ezen szavai gyakran hangzottak el a bevezetőkben, és a nagy kérdés még most is ez. Hová vezet ez az egész? Az első sorozat kiemeli Lelouch céljait: azt, hogy bosszút akar állni az anyja gyilkosán, és egy új világot akar építeni a húgának, Nunnallynak, ahol boldogan élhet. Ezért hozta létre a Fekete Lovagok Rendjét, a saját seregét, hogy elpusztíthassa, majd újraépítse a világot.

2018. Egy évvel a Fekete Lázadás után járunk, ami elbukott, és a nép úgy tudja, vezérük, Zero halott. A japán nép helyzete ezután talán csak rosszabbodott, annak ellenére, hogy Kururugi Suzaku azóta Őfelsége egyik személyes embere lett, ezzel továbbra is folytatva tervét, hogy ő belülről fogja megváltoztatni ezt a világot. És ezúttal nem válogat az eszközökben, hogy elérje célját…

Lelouch életben van. Újra az akadémián tanul és illegális fogadásokra jár, néha öccsét is belerángatva a dolgaiba. - Öcs? Várjuk csak... nem húga volt?! - Hamar kiderülnek ám a dolgok, hogy Lelouch nem egészen úgy emlékszik múltjára, ahogyan volt. A lázadókat pedig nem engedik csak úgy el. Ebben az egy évben szigorú megfigyelés alatt volt, és Rolo véletlenül sem az öccse, hanem a kivégzésével bízták meg, ha visszatérnének az emlékei. De ezt a társa, C.C. nem hagyhatja, hisz Lelouch még nem teljesítette be az egyezségüket. A Fekete Lovagok megmaradt csapata megtámadja a Bábel tornyot, ahová Lelouch éppen játszani ment. A helyzet nagyon hasonlóan alakul az első sorozat első részéhez képest, C.C.-t lelövik, Lelouch-t pedig ki akarják végezni. Majd C.C. felébreszti a mélyen elrejtett erejét. Visszatérnek az emlékei, a Geass is, és a céljai ismét világossá válnak.